Po pierwsze da się odpalać pliki Windows, choćby za pomocą Wine. Po drugie a ile RAMu byś chciał? Mniej niż 2GB, to już lagi będą niesamowite. Pamiętaj, że aby gra na MP była komfortowa, to serwer musi przekraczać wymagania gry kilkukrotnie.
Po co kombinujesz z odpalaniem plików Windows, jak serwer jest też w wersji na Linux? Nie oglądałem dokładnie, ale pobrałem serwer i przeglądałem readme i jest tam instrukcja, jak uruchomić serwer na Linux.