U mnie ten fragment konfigu wygląda dokładnie tak samo, żaden inny konfig nie nadpisuje tych ustawień. Zobacz czy nie masz innych konfigów w folderze TR'a. Konfigi o ile dobrze pamiętam wczytywane są po kolei, alfabetycznie i każdy kolejny nadpisuje ustawienia poprzedniego jeśli takowe są obecne. Jeśli wszystko wygląda w porządku z konfigami, to sugeruję Ci przeinstalowanie moda.
Nie jestem też pewien, ale zobacz czy nie pomoże umieszczenie Module Menager'a w wersji 2.5.6, zamiast jakiejś starszej - jeśli takową masz. To akurat strzał na ślepo, bo nawet nie wiem czy MM jest wymagany przez TR'a.